呼吸道感染作為全球疾病負擔(dān)排行榜前列的疾病之一，病原組成復(fù)雜多樣，約50％的患者難以明確病原。過去十年，宏基因組高通量測序 (mNGS) 的發(fā)展為疑難危重人群的感染疾病診斷做出了長足的貢獻；如今，靶向高通量測序 (tNGS) 技術(shù)結(jié)合了病原富集技術(shù)和高通量測序技術(shù)的優(yōu)點，不僅能夠解決mNGS價格昂貴、可及性偏低的問題，同時兼顧廣譜性與高靈敏度，為廣大呼吸道感染患者提供了新的選擇。

華大基因已在病原微生物測序領(lǐng)域深耕多年，自2014年于國內(nèi)率先推出mNGS產(chǎn)品PMseq®以來，持續(xù)引領(lǐng)行業(yè)發(fā)展，參與數(shù)十項專家共識與標準制定，發(fā)表相關(guān)文章50余篇，擁有核心技術(shù)與軟件著作權(quán)百余項，得到臨床的廣泛認可。今天，華大基因重磅發(fā)布全新tNGS檢測產(chǎn)品“PTseqTM呼吸道感染病原微生物靶向高通量基因檢測”，重新定義病原測序產(chǎn)品應(yīng)用方向，聚焦呼吸系統(tǒng)感染核心需求，積極推動感染性疾病精準診療發(fā)展。

病原學(xué)診斷是呼吸道感染精準防控的

必備條件

呼吸道感染是臨床最常見的感染性疾病之一，根據(jù)感染部位可分為上呼吸道感染和下呼吸道感染，其中下呼吸道感染 (主要包括肺炎和氣管/支氣管炎) 發(fā)病率高達6.3%，是全球第四大致死原因，在5歲以下兒童死因中位列首位，占所有死亡病例的13.32%[1-2]。

呼吸道感染病原譜具有種類多樣、變異頻繁的特點，往往還存在復(fù)雜的共感染。因此，進行及時準確的病原學(xué)診斷，盡早確定目標病原并進行針對性用藥治療，是改善患者預(yù)后、降低病死率和后遺癥發(fā)生率的關(guān)鍵。

tNGS進行病原檢測性價比更高，

讓感染精準防控技術(shù)可及

近年來，隨著分子生物檢測技術(shù)的不斷發(fā)展，病原微生物檢測手段也快速升級。宏基因組高通量測序 (metagenomics next generation sequencing, mNGS) 技術(shù)的應(yīng)用開啟了呼吸道感染病原診斷的新篇章，能夠無預(yù)設(shè)、無偏倚地檢測上萬種病原微生物。然而，mNGS也存在檢測費用較高、檢查結(jié)果易受樣本中人源序列與定植微生物序列含量的干擾[3]、DNA病原體與RNA病原體需要兩次檢測等痛點，這促使我們?nèi)�尋求一種新的突破。

基于華大基因mNGS產(chǎn)品PMseq®十年檢測積累的大數(shù)據(jù)，我們篩選出呼吸道感染高頻檢出病原體，發(fā)現(xiàn)百余種病原微生物就能夠有效解決95%以上的呼吸道問題。

采用靶向高通量測序 (targeted next-generation sequencing，tNGS) 技術(shù)，我們實現(xiàn)了有效性和性價比的平衡，提升精準防控感染的技術(shù)可及性，從而為更多呼吸道感染患者精準診療提供另一種選擇，普惠大眾。

華大基因一直以來致力于為患者提供更加精準、高效和經(jīng)濟的感染性疾病診斷產(chǎn)品，參與數(shù)十項專家共識與標準制定，發(fā)表相關(guān)文章50余篇，擁有核心技術(shù)與軟件著作權(quán)百余項。

基于病原微生物高通量基因測序領(lǐng)域十年產(chǎn)品技術(shù)研發(fā)和五年臨床轉(zhuǎn)化經(jīng)驗，華大基因全新打造PTseqTM呼吸道感染病原微生物靶向高通量基因檢測產(chǎn)品。

該產(chǎn)品依托國產(chǎn)自主測序平臺、專利引物設(shè)計系統(tǒng)及獨有污染校正算法，基于tNGS技術(shù)進行檢測，同時具備測序技術(shù)的廣譜性優(yōu)勢和多重PCR技術(shù)的高靈敏度優(yōu)勢，兼具檢測性能與高性價比，檢測范圍覆蓋268種靶標，不僅涵蓋95%以上的呼吸道感染常見核心病原體，同時可進行重點耐藥基因和毒力基因的鑒定，全方位助力個體化抗感染治療方案的制定，降低耐藥發(fā)生風(fēng)險，助力感染精準診療。

覆蓋268種靶標，包括227種病原微生物、30種耐藥基因和11種毒力基因

二

交付流程

從收到合格樣本至報告出具，全流程＜18h

三

產(chǎn)品特點

PTseqTM檢測產(chǎn)品基于擁有自主知識產(chǎn)權(quán)的專利引物設(shè)計系統(tǒng)和獨有污染校正算法所研發(fā)，促進高靈敏度與高特異性兩全其美：

核心引物設(shè)計系統(tǒng)，助力病原體高效擴增

經(jīng)華大臨床級別微生物序列數(shù)據(jù)庫精準選擇病原體特異性區(qū)域，高效引物設(shè)計算法+多靶點引物設(shè)計保障病原靶標高效擴增，大幅提升結(jié)核/真菌/胞內(nèi)菌/RNA病毒/耐藥基因/毒力基因等難檢靶標陽性率，最低檢測限可低至50 copies/mL。

精準污染過濾算法，確保檢測準確可靠

精準污染校正算法+雙Index建庫，高效辨別特異性檢出序列與污染序列，最大限度解決交叉污染問題，降低檢測結(jié)果假陽性率，確保檢測結(jié)果穩(wěn)定可靠。

02 精心設(shè)置病原靶標，適合多種臨床場景

重點物種精準分型，助力臨床鑒別診斷

227種病原微生物檢測靶標覆蓋細菌、病毒、真菌、寄生蟲、支原體、衣原體與立克次體等病原體類型，適合各類疑似混合感染場景；結(jié)核/非結(jié)核分枝桿菌鑒別，腺病毒/流感病毒等重點病毒分型，助力癥狀相似疾病鑒別診斷場景，輔助重點人群精細化診療。

耐藥毒力同步識別，拓展臨床應(yīng)用價值

覆蓋耐藥機制明確的CTX-M、KPC、OXA、MecA、NDM等在內(nèi)的30種代表性耐藥基因，覆蓋致病機理明確的含高毒力肺炎克雷伯菌的rmpA、iutA基因，金黃色葡萄球菌eta，etb基因，及大腸埃希菌iroN，iutA基因等在內(nèi)的11種重點毒力基因，輔助臨床進一步明確責(zé)任病原體，助力臨床精準用藥。

03 高性價比省時省力，聚焦患者核心需求

省時省力：DNA病原體+RNA病原體一步到位，杜絕單一樣本兩次送檢。

高性價比：價格遠低于mNGS檢測技術(shù)。

04 標準化質(zhì)量管理體系，結(jié)果性能穩(wěn)定

實驗室能力認可：國內(nèi)率先在高通量測序領(lǐng)域獲實驗室質(zhì)量規(guī)范ISO 15189:2012醫(yī)學(xué)實驗室質(zhì)量和能力認可.

全國實驗室室間質(zhì)評：四地醫(yī)學(xué)檢驗實驗室均通過國家衛(wèi)健委臨檢中心“下呼吸道感染宏基因組測序室間質(zhì)評”（DNA）和“傳染病病毒核酸檢測室間質(zhì)評”（RNA）雙流程。

  結(jié)  語  

在病原微生物檢測技術(shù)眾多的如今，如何選擇合適的檢測方法，以期更好地解決臨床問題，是實現(xiàn)感染性疾病精準診療的重要論題。專家指出：“不同的病原學(xué)診斷方法都有其各自的適用場景與前提，需要根據(jù)患者群體、病情特點、可疑病原微生物類別、當(dāng)?shù)貙嶒炇覘l件，選擇適宜檢測方法”[3]。

PTseqTM兼顧廣譜性、高靈敏性和高性價比的特點，與華大現(xiàn)有病原檢測產(chǎn)品互相搭配，將成為華大病原微生物檢測產(chǎn)品體系中的有力補充，可差異化滿足感染診斷的需求，進一步推動感染性疾病精準診療進一步發(fā)展。

參考文獻：
[1]Global Burden of Disease Collaborative Network. Global Burden of Disease Study 2019 (GBD 2019) Results. Seattle, United States: Institute for Health Metrics and Evaluation (IHME), 2020.
[2]Wu X, Li Y, Zhang M, et al. Etiology of Severe Community-Acquired Pneumonia in Adults Based on Metagenomic Next-Generation Sequencing: A Prospective Multicenter Study. Infect Dis Ther. 2020;9(4):1003-1015.
[3]中華醫(yī)學(xué)會呼吸病學(xué)分會.下呼吸道感染宏基因組二代測序報告臨床解讀路徑專家共識[J].中華結(jié)核和呼吸雜志, 2023, 46(4):322-335.